RNA电泳全攻略:检测RNA完整性

时间: 2025-08-04
作者: 百灵威
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RNA琼脂糖凝胶电泳是检测RNA质量和分离特定RNA的重要技术。与DNA电泳不同,RNA极易被RNase降解,因此实验全程需使用RNase-free耗材并避免污染。电泳方式分为非变性电泳和变性电泳。关键试剂包括琼脂糖、TAE/TBE缓冲液、RNA上样缓冲液(含甲醛或甘油),以及高灵敏度染料。

实验中,RNA样品需与Loading Buffer混合(变性电泳需甲醛或乙二醛),电泳后通过核酸染料显影。28S/18S rRNA比例(真核生物)可评估完整性,若条带模糊或拖尾则提示降解。若需更高灵敏度检测(如小RNA),可选用变性凝胶或Northern Blot。该技术广泛应用于RNA提取质检、基因表达分析及ncRNA研究,是分子生物学实验的基础步骤。
凝胶制备试剂
1.非变性电泳(常规检测)
品名 CAS 货号
Agarose, high gel strength
琼脂糖
9012-36-6 160507
Tris-acetic acid electrophoresis buffer (50×TAE)
Tris-乙酸电泳缓冲液(50×TAE)
/ 9456123
RNA染料
品名 CAS 货号
SUPER Green I nucleic acid gel stain, 10,000× concentrate in DMSO (Electrophoresis Grade)
SUPER Green I 核酸染料
/ 1912431
Ethidium bromide, 95%
溴化乙啶
1239-45-8 500224
2.变性电泳(检测完整RNA或小RNA)
品名 CAS 货号
Formaldehyde, 37% solution in H2O, stabilized with MeOH
甲醛
50-00-0 226396
危化品
MOPS sodium salt, 99.5%
MOPS 钠盐
71119-22-7 122040
Agarose, Electrophoresis Grade
琼脂糖
9012-36-6 917815
Glyoxal, 40 wt.% solution in H2O
乙二醛
107-22-2 333902
Dimethyl sulfoxide, 99%
二甲基亚砜
67-68-5 984549
PB Phosphate buffer solution, 0.2 mol/L, pH 7.2-7.4
PB磷酸盐缓冲液
/ 9456115
RNA样品处理试剂
品名 CAS 货号
Glycerol, 99%
甘油
56-81-5 262536
Bromophenol Blue, for analysis, Indicator
溴酚蓝
115-39-9 978967
Ethylenediaminetetraacetic acid, 99%
乙二胺四乙酸
60-00-4 477323
耗材和小型仪器
品名 CAS 货号
Pipette tips, 10 μL, clear, 1000 tips/pack
移液器吸头
/ 920067
Single-channel mechanical pipettor, Volume range: 0.1-2.5μL, Increment: 0.05μL
单道手动可调移液器
/ 991313
Centrifuge tube, 50 mL, vertical, with scale, conical bottom, sterile, 25 pcs/bag, 2 bags/case
离心管
/ 958546
PCR tubes, 0.2 mL, individual, attached flat cap,fluorescent quantitation, 500 tubes/pack
PCR单管
/ 1438746
PCR tubes, 0.2 ml, strips of 8, thin-wall, 125 strips/pack
PCR条管
/ 996430
智慧实验室
品名 CAS 货号
FindMolecule ELN, Academic Pro.
ELN电子记录本系统服务
/ 9269009
Bio-Vanguard
品名 CAS 货号
Bio-Vanguard® Disinfectant Spray
清萨灵®消毒剂
/ 916670
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